Conference Abstract | Volume 8, Abstract ELIC2025199 (Oral 005) | Published: 08 Aug 2025
Sanaba Boumbaly1,&, Jacob Camara1, Moussa Condé1, Eugène Kolié1, Mamadou Baldé1, Noudine Ibrahim1, Mohamed Lamine Kaka2, Saa Lucien Millimono3, Kékoura Ifono3, N’fa Amara Traoré4, Enogo Koivogui4, Giuditta Annibaldis5, Sophie Emilie Durafour5, Sarah Ryther5, Barrè Soropogui1, Fanta Bérété1, Mamady Coulibaly1, Philippe Lemey6, Liana Eleni Kafetzopoulou6, Alimou Camara1
1Centre de Recherche en Virologie/Laboratoire des Fièvres Hémorragiques Virales de Guinée (CRV-LFHVG), Conakry, République de Guinée, 2Centre de Traitement Epidémiologique (CTEpi) de Matoto, Conakry, République de Guinée, 3Laboratoire des Fièvres Hémorragiques Virales de Gueckédou, Guéckédou, République de Guinée, 4Agence Nationale de Sécurité Sanitaire (ANSS), Conakry, République de Guinée, 5Bernhard-Nocht Institute for Tropical Medicine (BNITM), Hambourg, Allemagne, 6Département de Microbiologie, Immunologie et de Transplantation, Institut Rega KU Leuven, Belgique
&Corresponding author: Sanaba Boumbaly, Centre de Recherche en Virologie/Laboratoire des Fièvres Hémorragiques Virales de Guinée (CRV-LFHVG), Conakry, République de Guinée. Email: drboumbaly@yahoo.fr
Received: 31 Mar 2025, Accepted: 09 Jun 2025, Published: 08 Aug 2025
Domain: Infectious Disease Epidemiology
Keywords: Flambée, épidémie, fièvre Lassa, cas index, Guinée
©Sanaba Boumbaly et al. Journal of Interventional Epidemiology and Public Health (ISSN: 2664-2824). This is an Open Access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution International 4.0 License (https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/), which permits unrestricted use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original work is properly cited.
Cite this article: Sanaba Boumbaly et al., Apport de l’investigation Faunistique chez le cas index probable d’une flambee nosocomiale de fievre Lassa a Conakry. Journal of Interventional Epidemiology and Public Health. 2025;8(ConfProc5):00005. https://doi.org/10.37432/jieph-confpro5-00005
La fièvre Lassa, infection à Arenavirus ayant pour réservoir le rat Mastomys, est endémique en Guinée. En Aout 2022 une flambée d’épidémie nosocomiale a éclaté à Conakry. Le cas index probable est décédé avant d’être prélevé. La présence de l’hôte réservoir étant un indicateur de la probabilité que les humains soient infectés, une investigation faunistique autour du cas index pour apporter des informations supplémentaires a été l’objet de ce travail.
Ont été utilisées la collecte de rats avec les pièges chairman, la RT-PCR pour la détection du virus Lassa (Altona diagnostics) chez les malades et les rongeurs puis le séquençage à l’aide de la technologie MinION (Oxford Nanopore) avec une approche métagénomique en combinaison avec l’analyse bioinformatique.
Le virus Lassa a été identifié comme agent causal de l’épidémie. Des 16 prélèvements réalisés des cas contacts et/ou suspects, 6 ont été positifs (37,5%). Tous les cas confirmés sont du personnel médical et des contacts du cas probable index. Les contrôles ont permis de noter la disparition de la virémie pour 1, 2 et 2 personnes aux semaines 1, 2 et 4 respectivement. L’investigation de la faune dans l’environnement immédiat du cas index Douako à Kouroussa a permis de détecter 4 souches du virus Lassa à partir des pools de 55 Mastomys natalensis (7,27%). Le séquençage a permis d’obtenir 4 séquences complètes des souches humaines et une séquence faunistique complète. Toutes les souches humaines et faunistique appartiennent à la ligné IV du virus Lassa. La séquence obtenue à partir du rat présente suffisamment de différences génomiques par rapport aux séquences des souches humaines.
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